Ecología

Éste no es únicamente un libro de análisis, es fundamentalmente una obra de divulgación y sensibilización. Se dan criterios y elementos de análisis para encarar con mayores garantías esta etapa de cambio (crisis) que nos ha tocado vivir.

Los datos biológicos nos cuentan una gran cantidad de cosas sobre el mundo que nos rodea, y nos permite entender, por ejemplo, cómo se estructura la diversidad biológica, qué procesos condicionan la formación de comunidades biológicas o cómo diferentes impactos humanos afectan a cualquiera de los niveles de organización biológica. Este libro nos enseña a descifrar las historias que hay detrás de los datos.
¿Para quién es este libro? El libro va dirigido a estudiantes, profesores e investigadores del ámbito de las ciencias naturales que deseen iniciarse en el mundo de la investigación, entender en profundidad algunas de las principales técnicas de análisis de datos utilizadas en el ámbito de la ecología, o conocer la implementación de dichas técnicas en R, uno de los lenguajes de programación más utilizados en investigación científica.
El libro se construye sobre múltiples ejemplos y casos de estudio, para que el lector o lectora pueda ir entendiendo los conceptos a través de la práctica. Parte de conceptos muy básicos, tanto de programación en R como de estadística, para ir avanzando a través de algunas de las técnicas de análisis de datos más frecuentemente utilizadas en el ámbito de la ecología, incluyendo los modelos lineales, los modelos lineales generalizados, los modelos aditivos generalizados, los árboles de regresión y clasificación y los modelos mixtos.
Los autores del libro son profesores de Ecología y Botánica en la Universidad Rey Juan Carlos y han impartido multitud de cursos de estadística aplicada y análisis de datos en ecología en diferentes instituciones nacionales e internacionales. Luis Cayuela investiga los mecanismos ecológicos y biogeográficos que generan los patrones de diversidad en bosques tropicales. Marcelino de la Cruz está especializado en ecología espacial y conservación vegetal. Muchas de las herramientas que han desarrollado durante su investigación están publicadas en forma de paquetes de R en el repositorio oficial.
Índice:
1. Una introducción a R
1.1. ¿Cómo instalar R?
1.1.1. CRAN y paquetes
1.2. La sintaxis de R
1.3. Tipos de objetos en R y la funcion str()
1.3.1. Vectores y matrices
1.3.2. Tablas de datos
1.3.3. Listas
1.3.4. Funciones
1.3.5. Otros tipos de objetos
1.4. El menú de ayuda: aprendiendo a ser autosuficientes
1.5. Recomendaciones para organizar una sesion de trabajo
1.6. R-Commander
1.7. Cómo leer datos en R
1.8. Funciones básicas para la manipulación de datos
1.8.1. Crear subconjuntos de datos
1.8.2. Fusionar tablas de datos
1.8.3. Aplicar funciones sobre subconjuntos de nuestros datos
1.9. Cómo repetir un procedimiento con el comando for()
1.10. Citando R en los trabajos científicos

2. Analisis exploratorio y representación gráfica de datos
2.1. Una introducción a los gráficos con R
2.1.1. El sistema de gráficos en R
2.1.2. Formatos básicos de gráficos
2.1.3. Dispositivos gráficos
2.1.4. Representación de gráficos múltiples
2.1.5. Funciones gráficas de bajo nivel
2.2. Ejemplos de análisis exploratorio
2.2.1. Datos continuos univariados: distribuciones de frecuencias
2.2.2. Datos continuos bivariados: examinando relaciones entre variables
2.2.3. Extensión de técnicas bivariadas a datos multivariados
2.2.4. Datos cuantitativos agrupados y datos cualitativos
2.3. Gráficos condicionados del paquete lattice
2.4. Otras soluciones gráficas: ggplot2

3. Conceptos básicos de estadística
3.1. Estadística descriptiva
3.1.1. La distribución normal
3.2. Estadística inferencial
3.2.1. Introducción al contraste de hipótesis
3.2.2. Errores estadísticos en el contraste de hipótesis
3.2.3. Pruebas estadísticas sencillas para datos cuantitativos
3.2.4. Correlación

4. Introducción a los modelos lineales: regresión
4.1. Organizando el flujo de trabajo para el análisis de datos con modelos lineales
4.2. Regresión simple
4.2.1. Fundamentos teoóicos del modelo de regresión
4.2.2. Cómo ajustar un modelo lineal en R
4.2.3. Contraste de hipótesis y variación explicada por el modelo
4.2.4. Interpretación del modelo
4.2.5. Revisión de los supuestos del modelo
4.3. Regresión múltiple
4.3.1. Ajuste del modelo
4.3.2. Contraste de hipótesis y variación explicada por el modelo
4.3.3. Interpretación y representación gráfica del modelo ajustado
4.3.4. Coeficientes de regresión estandarizados
4.3.5. Multicolinealidad
4.4. Regresión de tipo I y de tipo II

5. Modelos factoriales: análisis de la varianza (ANOVA) y de la covarianza (ANCOVA)
5.1. Anaáisis de la varianza (ANOVA)
5.1.1. Test post hoc y comparaciones múltiples
5.1.2. Evaluación de los supuestos del modelo
5.1.3. Cambio del nivel de referencia en los contrastes de los niveles del factor
5.2. Análisis de la covarianza (ANCOVA)
5.2.1. Homogeneidad de pendientes
5.2.2. ¿Qué ocurre si la interacción es significativa?
5.3. Otros modelos factoriales
5.3.1. Interacción entre factores
5.3.2. ¿La colinealidad tiene sentido cuando las variables explicativas son categóricas?
5.3.3. Sumas de cuadrados en modelos factoriales ¿cuál es más conveniente?

6. Introducción a los modelos lineales generalizados (GLM)
6.1. Estructura de los GLM
6.1.1. El predictor lineal
6.1.2. La función de vínculo
6.1.3. La componente aleatoria
6.1.4. Relación entre el modelo lineal y el GLM
6.2. La función glm()
6.3. Estimación de parámetros por máxima verosimilitud
6.3.1. Devianza residual y devianza explicada

7. GLM para variables respuesta de tipo conteo
7.1. GLM con distribuciones de errores Poisson
7.1.1. Análisis exploratorio y ajuste del modelo
7.1.2. Inferencia en GLM: resolviendo hipótesis sobre causalidad
7.1.3. Interpretación del modelo
7.1.4. Revisión de los supuestos del modelo e idoneidad de la familia de distribución de errores
7.2. GLM con distribución de errores binomial negativa

8. GLM con distribuciones de errores binomiales
8.1. GLM de respuesta binaria
8.1.1. Presentación del caso de estudio: estrategia reproductora de una especie de alga invasora
8.1.2. Analisis exploratorio y ajuste del modelo
8.1.3. Resolución de hipótesis
8.1.4. Interpretación del modelo
8.1.5. Revisión de los supuestos del modelo
8.2. GLM de respuesta de tipo proporción
8.2.1. Presentación del caso de estudio: ¿cuáles son las mejores condiciones de germinación para el ailanto?
8.2.2. Análisis exploratorio y ajuste del modelo
8.2.3. Resolución de hipótesis
8.2.4. Interpretación del modelo
8.2.5. Revisión de los supuestos del modelo

9. Extensiones de la regresión
9.1. Modelos polinómicos
9.2. Modelos aditivos generalizados (GAM)
9.2.1. ¿En qué consiste el suavizado?
9.2.2. El modelo aditivo generalizado (GAM)
9.2.3. Funciones para ajustar un GAM en R
9.2.4. Evaluación del modelo
9.3. Árboles de regresión y de clasificación (CART)
9.3.1. El paquete rpart
9.3.2. Alternativas a los árboles de regresión y clasificación

10. Introducción a los modelos mixtos
10.1. ¿Efecto fijo o aleatorio?
10.2. Modelos mixtos en R: los paquetes nlme y lme4
10.2.1. La función lme()
10.2.2. La función lmer()
10.3. Entendiendo los modelos mixtos
10.3.1. Un ejemplo con bentos marino
10.3.2. Una aproximación al análisis de los datos con modelos lineales
10.3.3. Reanalizando los datos con modelos lineales mixtos
10.4. Inferencia con modelos mixtos
10.4.1. Test de la F
10.4.2. Test de hipótesis para modelos anidados (likelihood ratio test)
10.4.3. Comparación de modelos con AIC
10.5. Análisis de los residuos
10.6. Estimando componentes de la varianza en modelos mixtos
10.7. Modelos lineales generalizados mixtos (GLMM)
10.8. Otras funciones para ajustar modelos mixtos en R
10.9. Evitando problemas de ajuste
Apéndice: paquetes de R
Referencias
Índice alfabético

Los riesgos son connaturales a las sociedades modernas. Las amenazas relacionadas con los sistemas financieros, los sistemas políticos, las tecnologías de la información, el terrorismo, la seguridad alimentaria, las epidemias o los desastres naturales asociados al cambio climático, entre muchas otras, demandan marcos metodológicos rigurosos para el análisis y la gestión de riesgos. De esto se encarga la disciplina global del análisis de riesgos, cuyos conceptos básicos se esbozan en este libro. En particular, incide en la necesidad de predecir adecuadamente la ocurrencia de las posibles amenazas a las que se enfrenta el sistema sobre el que se está realizando el análisis, así como predecir sus impactos, para después integrar toda esta información en un marco coherente y riguroso que ayude a tomar las mejores decisiones en relación con la gestión de riesgos. El objetivo será reducir la probabilidad de que se produzcan las amenazas consideradas y, llegado el caso, tratar de minimizar su impacto. Los autores realizarán este recorrido por el análisis de riesgos apoyándose en ejemplos y casos que han ido analizando estos años en dominios como la ciberseguridad, la seguridad aérea, la epidemiología, la seguridad nacional, el sector del seguro y los vehículos autónomos.

Publicación divulgativa que recoge las iniciativas acometidas dentro de la gestión del medio natural en Andalucía, para fomentar el interés por la naturaleza en todos sus aspectos y promover el aprovechamiento sostenible de los recursos naturales como mayor garantía de la conservación de los recursos naturales.

La crítica del mundo industrial y en particular aquella crítica del lugar que ocupa la tecnología en nuestras sociedades modernas, nos ha conducido paralelamente a desarrollar la crítica del progresismo bien arraigado en el imaginario de las diferentes utopías socialistas, y a ver cómo este progresismo adulador de la ciencia y la abundancia industrial apuntaba a una metafísica. Es también al constatar la importancia del análisis ecológista, así como los terribles acontecimientos que se imponen hoy a nosotros, como se podía advertir que ninguna base material podría sencillamente sostener estos sueños pueriles de abundancia, de tecnologías sofisticadas democráticamente repartidas, de fin del trabajo. Pero una repugnancia más subjetiva a este tipo de sueños se abría paso en nosotros: ¿qué idea del hombre y de la libertad se escondían detrás de esas utopías? Y sobre todo ¿qué idea del hombre y de la libertad había que defender en su lugar? El ludismo fue un movimiento obrero que adquirió auge en Inglaterra a partir del odio incondicional hacia las máquinas Aprincipios del siglo XIX, y cuyas acciones se basaban en la revuelta espontánea y desorganizada, atacando con frecuencia a los instrumentos de producción. Sus seguidores se llamaban ludistas o luditas.

Olvidada durante gran parte del siglo XX, la geografía social de Élisée Reclus está siendo revalorizada en la actualidad. Su original pensamiento crítico combina ciencia y teoría política para explicar la interacción entre los fenómenos naturales y sociales a lo largo del tiempo. Empleando un método dialéctico de análisis de la sociedad humana, Reclus describe procesos contradictorios de evolución y revolución que no se resuelven necesariamente en el advenimiento del comunismo, la única forma de sociedad capaz de establecer la armonía entre el medio natural y la humanidad, y entre la organización social y la libertad individual. Frente al comunismo autoritario y al anarquismo individualista, Reclus atribuye un papel fundamental a la moralidad y a la voluntad libre de los seres humanos en el esfuerzo revolucionario colectivo que conducirá a la anarquía, la “más alta expresión del orden”. Los textos seleccionados en la presente edición constituyen una muestra de los diferentes aspectos de la propuesta revolucionaria de este autor prolífico cuya obra visionaria nos invita a renovar la manera de afrontar los retos políticos, sociales y ecológicos del siglo XXI.

Los problemas ambientales ocupan hoy un lugar central en el debate social. La pérdida de calidad de nuestro entorno físico y biótico ha dejado de ser una hipótesis pesimista para las generaciones futuras. Sus efectos en los servicios y los recursos que este nos procura son ya una evidencia en las condiciones de vida de la población actual.

Las relaciones que mantienen las sociedades humanas con el medio ambiente han sido un tema de interés recurrente para la Antropología. La variabilidad de las relaciones ambientales no refiere solo a los usos y las prácticas de los grupos sociales sino que incluye la concepción misma de la naturaleza, revelando la diversidad de los proyectos culturales en el espacio y en el tiempo.

Los trabajos publicados en este volumen muestran el potencial de la Antropología Ambiental en la comprensión de la problemática ambiental contemporánea y su amplia gama de intereses. En un momento en que la interferencia de los seres humanos en el funcionamiento del planeta está planteando la identificación de una nueva época geológica, el Antropoceno, el análisis sociocultural proporciona argumentos valiosos y deviene una urgente necesidad.

El Doctor Martín Vide, importante científico de nuestro país en cuestiones de cambio climático, así como una de nuestras primeras autoridades en Meteorología, junto con José Luis Gallego, conocido y prestigioso periodista especializado en medio ambiente, han realizado esta obra de enfoque divulgativo con el objetivo de explicarnos los aspectos fundamentales para comprender el cambio climático y las principales maneras en que podemos colaborar para mitigarlo. Éste es un libro imprescindible para todas aquellas personas interesadas en un tema crucial para el futuro de la humanidad.

Esta obra es una aportación al estudio biogeográfico de Aitana, espacio que atesora un incomparable patrimonio natural y cultural. Un nutrido grupo de especialistas se adentran en la investigación de sus suelos, vegetación, fauna y paisaje desde diversas perspectivas, métodos y técnicas de análisis.